Pengenalpastian Gen Hab Berkaitan Dengan Perkembangan Kecederaan Buah Pinggang Akut

Hubungi:joanna.jia@wecistanche.com/ WhatsApp: 008618081934791

Xiao Lin Jianchun Li Ruizhi Tan Xia Zhong Jieke Yang Li Wang

Makmal Profilaksis dan Rawatan Fibrosis Organ oleh Gabungan Perubatan Tradisional Cina dan Barat, Pusat Penyelidikan Perubatan Tradisional Cina dan Barat Bersepadu, Hospital Perubatan Tradisional Bersekutu, Universiti Perubatan Barat Daya, Luzhou, China

ulasan cistanche pukal :sangat bagus untukfungsi buah pinggang

Kata kunci

Analisis rangkaian ekspresi bersama gen berwajaran·Akutbuah pinggangkecederaan·Rplp1.Lgals1

Abstrak

Latar Belakang: Akutbuah pinggangkecederaan(AKI) ialah sindrom klinikal yang teruk, menyebabkan beban perubatan dan sosioekonomi yang mendalam di seluruh dunia. Kajian ini bertujuan untuk meneroka sasaran molekul asas yang berkaitan dengan perkembangan AKl. Kaedah: Pangkalan data awam berasal daripada pangkalan data NCBI GEO (nombor siri: GSE121190) dan kaedah analisis rangkaian ekspresi bersama gen berwajaran (WGCNA) yang mantap dan tidak berat sebelah untuk mengenal pasti gen hab dan laluan laluan yang berpotensi digunakan. Tambahan pula, gen tidak berat sebelah telah disahkan dalam 2 model klasik AKl dalam model tikus: AKI yang ditubuhkan secara kimia oleh AKI yang disebabkan oleh cisplatin-dan iskemia-reperfusion. Keputusan: Sebanyak 17 modul akhirnya diperoleh dengan kaedah WGCNA yang tidak berat sebelah, di mana gen dalam modul turquoise memaparkan korelasi yang kuat dengan pembangunan AKl. Di samping itu, hasil ontologi gen mendedahkan bahawa gen dalam modul turquoise terlibat dalam buah pinggangkecederaandan fibrosis buah pinggang. Oleh itu, gen hab telah disahkan lagi dengan kaedah eksperimen dan terutamanya memperoleh Rplp1 dan Lgals1 sebagai gen calon utama yang berkaitan dengan perkembangan AKI dengan kelebihan PCR kuantitatif, pembongkaran Barat, dan pendarfluor tisu in situ. Yang penting, ekspresi Rplp1 dan Lgals1 pada tahap protein menunjukkan korelasi positif dengan fungsi buah pinggang, termasuk serum Cr dan BUN. Kesimpulan: Dengan kelebihan kaedah bioinformatik yang tidak berat sebelah dan pengesahan eksperimen yang berbangkit, kajian ini meletakkan asas asas untuk patogenesis dan pembangunan agen terapeutik AKI.

pengenalan

Akutbuah pinggangkecederaan(AKI) adalah sindrom klinikal biasa, termasuk pelbagai proses patofisiologi [1, 2]. Sebenarnya, pemulihan fungsi buah pinggang dalam AKI selalunya tidak lengkap dan beransur-ansur berkembang menjadi CKD, yang akhirnya berkembang menjadi ESRD [3]. AKI adalah penyumbang penting kepada CKD dan akibat ESRD [4]. Dalam perkembangan peralihan AKI ke CKD, keabnormalan struktur ditunjukkan sebagai deposit pengembangan matriks dalam kedua-dua mesangium dan tubulointerstitium. Penyasaran

pada fibrosis buah pinggang selepas AKI telah dianggap sebagai pendekatan terapeutik untuk meminimumkan peralihan [5-7].

Cr plasma dinaikkan dianggap sebagai kriteria klasik untuk mendiagnosis AKI dalam dekad yang lalu. Tetapi ia mungkin bukan penanda bio yang betul kerana ia sering mencadangkan keseimbangan pengeluaran dan perkumuhan Cr [8]. Walaupun menghapuskan hasil jangka pendek dan jangka panjang AKI adalah mendesak, terapi terapeutik dan penanda bio pengesanan awal masih terhad. Di samping itu, pada masa ini tiada biomarker klinikal yang sah untuk diagnosis fibrosis buah pinggang selepas AKI. Oleh itu, adalah berfaedah untuk membangunkan lebih banyak terapi terapeutik dan memikirkan potensi penanda bio untuk rawatan fibrosis dan melambatkan perkembangan [1, 8].

Oleh kerana metodologi biologi molekul yang cacat, masih terdapat batasan tertentu dalam penerokaan menyeluruh keseluruhan sistem biologi dalam penyakit [9]. Sebagai kaedah biologi sistematik untuk menerangkan corak persatuan genetik antara sampel yang berbeza, analisis rangkaian ekspresi bersama gen berwajaran (WGC-NA) digunakan terutamanya untuk menyaring dan mengenal pasti modul yang sangat kolaboratif. Mengikut dalaman modul dan hubungan antara modul dan feno- jenis, ia telah digunakan secara meluas dalam kajian analisis omik untuk melombong potensi biomarker atau sasaran terapeutik [10-12]. Berbanding dengan data yang hanya menumpukan pada ekspresi pembezaan, WGCNA mempunyai kelebihan berikut: ia boleh memanfaatkan sepenuhnya maklumat, mengaitkan selang-seli fenotip yang menarik dan mengelakkan kecacatan analisis ekspresi pembezaan yang menetapkan ambang buatan secara buatan. Lebih-lebih lagi, WGCNA bukan sahaja boleh menganalisis tahap mRNA sampel tetapi juga digunakan untuk penyelidikan RNA mikro dan proteomik, yang sangat membantu dalam mencari penanda biologi yang berpotensi dan sasaran terapeutik [13, 14].

Dalam kajian ini, kami melakukan kaedah bioinformatik yang mantap - WGCNA - untuk menganalisis profil ekspresi (nombor siri NCBI GEO: GSE121190) dan bertujuan untuk mengenal pasti laluan dan gen yang berpotensi yang dikaitkan dengan perkembangan AKI. Yang penting, kami menggunakan kaedah percubaan untuk mengesahkan gen hab selanjutnya, supaya dapat memberikan pandangan baharu untuk kejadian, perkembangan dan rawatan AKI.

kaedah penawar buah pinggang cistanche reddit

Bahan dan Kaedah

Prapemprosesan Data

Set data diperolehi daripada pangkalan data GEO. Dalam kajian ini, 12 sampel set data GSE121190 telah digunakan untuk analisis WGCNA. Dua belas sampel termasuk kumpulan kawalan dan kumpulan AKI 3-/7-/14-hari yang disebabkan oleh asid folik (3 sampel setiap kumpulan). Pakej R "limma" digunakan untuk pembetulan latar belakang dan pemprosesan normalisasi dengan data asal. Jika berbilang probe sepadan dengan 1 gen, nilai purata dikira sebagai nilai ekspresi gen [9, 15].

Pembinaan Rangkaian Ekspresi Bersama dan Analisis Fungsian

Kemudian, ambang lembut dikira oleh algoritma WGCNA. Nilai bebas skala dan ketersambungan purata modul di bawah ambang lembut yang berbeza telah diuji dengan kaedah kecerunan untuk menentukan ambang lembut yang sesuai [13, 16, 17]. Dengan memilih nilai ambang lembut yang sesuai, rangkaian ekspresi bersama telah dibina untuk memastikan ketulenan keputusan, dan bilangan gen minimum dalam setiap modul tidak<30. then,="" use="" the="" r="" package="" "clusterprofiler"="" toolkit="" to="" perform="" go="" analysis="">

Pengesahan Gen Hab

Seterusnya, kami menganalisis gen hab mengikut nilai ambang dalam setiap modul dan memvisualisasikannya menggunakan perisian Cytoscape. Gen hab dianggap sebagai kriteria berikut: (a) nilai mutlak kepentingan gen (GS), FA 3/7/14 hari Lebih besar daripada atau sama dengan 0.2, dan (b) gen dalam modul utama telah dianalisis oleh pangkalan data STRING untuk menjana rangkaian interaksi protein-protein (PPI), dan 5 gen teratas sambungan tertinggi telah dianggap sebagai gen hab untuk pengesahan lanjut [20].

Model Haiwan yang Dicetuskan oleh Cisplatin dan Hypoxia-Iskemia

Tikus C57BL/6 jantan (tahap SPF, berumur 6∼8-minggu, 20∼25 g) telah dibeli daripada Chengdu Dashuo Experimental Animal Co., Ltd. (SCXK [Sichuan] 2015-030) dan ditempatkan dan dibiakkan di bawah syarat penjagaan standard di Pusat Haiwan Eksperimen Universiti Perubatan Barat Daya (SYXK [Sichuan] 2018-065). Tikus-tikus

Rajah 1. Pembinaan modul ekspresi kolaboratif. Dendrogram berkelompok 12 sampel. B Analisis topologi rangkaian untuk pelbagai ambang lembut (kuasa). C Modul ekspresi bersama yang dibina oleh algoritma hibrid dinamik. Setiap nod daun mewakili gen, dan warna yang berbeza mewakili modul yang berbeza dalam rajah pokok.

telah dikelaskan kepada 3 kumpulan (n=6 setiap kumpulan): kawalan, Cis-AKI dan IRI-AKI; tikus dalam kumpulan Cis-AKI telah disuntik cisplatin (Sigma-Aldrich, Amerika Syarikat) (15 mg / kg) melalui suntikan intraperitoneal [21]. Tikus dalam kumpulan IRI telah dibius dengan 1 peratus natrium pentobarbital dan diletakkan di atas selimut elektrik termostatik kecil untuk mengekalkan suhu badan pada 36 darjah. Selepas anestesia, hirisan mengapit dua hala diambil, dan arteri arteriovenous telah diapit

dengan klip arteri selama 35 min. Saline ditambah setitik demi setitik untuk mengekalkanbuah pingganglembap setiap 5 min. Selepas klip arteri dikeluarkan, hirisan dijahit, dan tikus diletakkan dalam persekitaran 37 darjah [22, 23]. Pada akhir tempoh percubaan, tikus dibunuh pada hari ke-3 dan ke-7, masing-masing. Sampel darah tikus adalah

diperoleh sebelum dislokasi serviks. Semua prosedur percubaan telah diluluskan oleh Jawatankuasa Etika Universiti Perubatan Barat Daya (nombor kelulusan: 201812-55).

Analisis Histologi dan Pengesanan Fungsi Buah Pinggang

Thebuah pinggangtelah dijadikan bahagian parafin mengikut kaedah konvensional. Secara ringkasnya,buah pinggangtisu telah ditetapkan dengan 10 peratus formaldehid, dehidrasi, dan tertanam dalam parafin [24]. Bahagian-bahagian itu telah dehidrasi dan diwarnai dengan hematoxylin dan eosin (Beyotime, China). Akhirnya, bahagian tersebut difoto dengan mikroskop slaid maya (VS120-S6-W, Olympus, Jepun). Pada masa yang sama, serum Cr dan BUN diukur mengikut arahan kit (Nanjing JianCheng, China).

Pengasingan RNA dan PCR Kuantitatif

Jumlah RNA diekstrak menggunakan kit pengekstrakan RNA (Tiangen, Beijing) dan DNA pelengkap diperoleh menggunakan Kit Transkripsi Songsang (Promega, Shanghai, China) mengikut arahan pengilang. Kemudian, PCR kuantitatif telah dilakukan dalam Sistem PCR Masa Nyata LightCycler® 480 II (Roche, Jerman). Primer telah disintesis oleh Sangon Biotech (Shanghai, China), dan jujukan tersedia dalam Jadual 1.

Penghapusan Barat

Jumlah protein telah diasingkan dan dibubarkan dalam penimbal RIPA. Seterusnya, kepekatan protein dikesan menggunakan BCA Protein Assay Kit (Beyotime Biotechnology, China). Sampel protein dijalankan pada 12 peratus natrium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel dan dipindahkan ke membran PVDF (Millipore, Danvers, MA, USA). Membran disekat dengan 5 peratus albumin serum lembu pada suhu bilik selama 1 jam dan diinkubasi pada 4 darjah semalaman dengan antibodi utama yang ditunjukkan: anti-Lgals1 (Cell Signaling Technology, Danvers, MA, USA, 1:1,{{10 }}) dan antibodi anti-Rplp1 (Invitrogen, Waltham, MA, USA, 1:500). Selepas itu, membran PVDF dibasuh dengan Tris-buffered Saline Tween dan diinkubasi pada

suhu bilik selama 1 jam dengan antibodi sekunder (Invitrogen, Waltham, MA, USA; 1:10,000). Band telah divisualisasikan menggunakan Kit Chemiluminescence ECL (Thermo, Waltham, MA, USA) dan dianalisis menggunakan perisian ImageJ.

In situ Immunofluorescence

Untuk imunofluoresensi tisu,buah pinggangtisu telah ditetapkan dengan 10 peratus larutan formaldehid dan dehidrasi, masing-masing, dengan 10, 20, dan 30 peratus sukrosa, diikuti dengan membenamkan dalam OCT. Sampel kemudian dibuat ke dalam bahagian 4-μm dan dibasuh 3 kali dengan PBS selama 5 minit. Tisu telah disekat dengan 5 peratus BSA selama 1 jam pada suhu bilik dan kemudian diinkubasi pada 4 darjah semalaman dengan antibodi utama yang ditunjukkan: anti-Lgals1 (Teknologi Isyarat Sel, Danvers, MA, Amerika Syarikat; 1: 200) dan antibodi anti-Rplp1 (Invitrogen, Waltham, MA, USA; 1:100). Keesokan harinya, tisu dibasuh dengan PBS selama 5 minit 3 kali, diikuti dengan pengeraman dengan antibodi sekunder terkonjugasi Alexa Fluor® 488-(Cell Signaling Technology, Danvers, MA, USA; 1:200) dan pada suhu bilik selama 1 jam Imej telah ditangkap oleh mikroskop slaid maya (VS120-S6-W, Olympus, Jepun).

Analisis statistik

Analisis statistik PCR dan Western blot masa nyata dilakukan oleh GraphPad Prism 7.0 (GraphPad Software, La Jolla, CA, USA). ANOVA sehala digunakan jika wujud lebih daripada 2 kumpulan perbandingan. p < 0.05="" telah="" dianggap="" sebagai="" perbezaan="">

Rajah 3. Analisis fungsi modul pirus. Hasil analisis pengayaan fungsi gen modul turquoise. Rangkaian B PPI gen hab dalam modul turquoise, dan hasilnya divisualisasikan oleh Cy- toscape. PPI, interaksi protein-protein; ECM, matriks ekstraselular.

Keputusan

Prapemprosesan Data

12 sampel data tatasusunan dalam set data yang dimuat turun GSE121190 telah dipraproses menggunakan pakej limma bahasa R. Untuk mendapatkan gen yang dikaitkan dengan AKI, adalah perlu untuk membandingkan perubahan ekspresi gen antara sampel normal dan AKI dan menyaring 25 peratus gen sebelum varians. Hasilnya, sejumlah 5,418 gen telah diperolehi untuk analisis WGCNA yang terakhir.

Pembinaan Modul Ekspresi Kolaboratif

Pertama sekali, sampel mula-mula dikelompokkan untuk membuang out-lier oleh alat hclust bahasa R. Keputusan dibentangkan dalam Rajah 1A. Kemudian, kami mengukur kebebasan dan ketersambungan purata modul pada ambang yang berbeza. Seperti yang ditunjukkan dalam Rajah 1B, ia boleh dinilai daripada rajah bahawa apabila nilai ambang adalah sama dengan 8, yang bukan sahaja menjadikan darjah sambungan purata rangkaian tidak terlalu rendah tetapi juga memastikan bahawa rangkaian yang dibina adalah hampir dengan bebas skala. rangkaian.

Dalam langkah seterusnya, kami menukar matriks bersebelahan kepada matriks pertindihan topologi untuk mengurangkan hingar dan korelasi palsu. Pokok pengelompokan sistem telah ditubuhkan melalui matriks pertindihan topologi, seperti yang ditunjukkan dalam Rajah 1C. Dan bilangan gen dalam setiap modul ditetapkan sebagai tidak kurang daripada 30 oleh algoritma ricih hibrid dinamik. Akhirnya, 17 modul diperoleh daripada pokok kluster sistem, dan bilangan gen yang terkandung dalam setiap modul ekspresi bersama ditunjukkan dalam Jadual 2.

Modul Utama dan Pemeriksaan Gen Hab

Selepas itu, kami menganalisis 3 modul teratas (modul coklat, biru dan biru) dan berusaha untuk mengetahui gen hab. Corak ekspresi gen dalam 3 modul telah dianalisis. Seperti yang dibentangkan dalam Rajah 2, hasilnya menunjukkan bahawa modul biru dan coklat berkorelasi negatif dengan perkembangan AKI, manakala modul biru berkorelasi positif dengan perkembangan AKI. Kami kemudian melakukan analisis fungsi dalam setiap modul dan mendapati bahawa gen yang terkandung dalam modul coklat, biru, dan biru berkait rapat denganbuah pinggang, pembangunan sistem genitouriner, beberapa proses metabolik penting, dan pemendapan matriks ekstraselular (ECM), yang berkaitan dengan fibrosis buah pinggang; khususnya, modul turquoise dianggap memainkan peranan penting dalam perkembangan fibrosis buah pinggang selepas AKI (butiran dibentangkan dalam Rajah 3A dan lihat bekalan dalam talian Rajah 1A, 2A; lihat www.karger.com/doi/ 10.1159/000511661 untuk semua bahan bekalan dalam talian). Kami kemudiannya berusaha untuk mencari gen hab dalam setiap modul, dan selepas penapisan awal, 5 gen teratas – Lgals1, Rplp1, Col3a1, Col6a2 dan Mgp – dalam modul turquoise telah dianggap sebagai gen hab (seperti ditunjukkan dalam Rajah 3B). Kami juga melakukan analisis yang sama dalam modul biru dan coklat tetapi gagal untuk mencari gen hab mempertimbangkan corak ekspresi dan GS mereka (seperti yang dibentangkan dalam bekalan dalam talian. Rajah 1B, 2B).

Penilaian Patologi Histologi dan Buah Pinggang

Fungsi

Seterusnya, kami membina model haiwan Cis-AKI dan IRI-AKI. Seperti yang ditunjukkan dalam bekalan dalam talian. Rajah 3a, hasil pewarnaan HE mencadangkan bahawa nekrosis tiub wujud dalam model Cis-AKI/IRI-AKI, dankecederaanditekankan dari semasa ke semasa. Sementara itu, kita juga dapat melihat bahawa berbanding dengan kumpulan kawalan, peningkatan pesat dalam serum Cr dan BUN dalam cara yang bergantung pada masa. Secara kolektif, semua keputusan ini menunjukkan kejayaan pembinaan model haiwan AKI.

Pengesahan Gen Hab

Untuk mengesahkan lagi kebolehpercayaan kaedah WGCNA dan gen hab skrin yang berkait rapat dengan perkembangan fibrosis buah pinggang, atas dasar di atas, kami berhasrat untuk mengesahkan ungkapan 5 gen hab teratas dalam model haiwan Cis-AKI dan IRI-AKI dengan kelebihan. PCR masa nyata, Western blotting, dan imunofluoresensi in situ. Tahap ekspresi mRNA Lgals1, Rplp1, Col3a1, Col6a2 dan Mgp dalambuah pinggangtikus telah dikesan oleh PCR masa nyata. Terdapat banyak laporan penyelidikan menunjukkan bahawa Col3a1, Col6a2, dan Mgp berkaitan dengan proses fibrosis buah pinggang [23, 25, 26]. Walau bagaimanapun, untuk Lgals1 dan Rplp1, tiada kajian telah dilakukan mengenai fibrosis buah pinggang selepas AKI, jadi Western blot dan immunofluorescence in situ digunakan untuk mengesahkan lagi ungkapan Lgals1 dan Rplp1. Seperti yang ditunjukkan dalam Rajah 4B, berbanding dengan kumpulan normal, tahap ekspresi Lgals1 dan Rplp1 dalam tikus Cis-AKI dan IRI-AKI juga meningkat dengan ketara. Tambahan pula, kami menilai lokasi Lgals1 dan Rplp1 oleh imunofluoresensi in situ. Seperti yang ditunjukkan dalam Rajah 5, Rplp1 terletak terutamanya dalam glomeruli dan tiub renal, dan Lgals1 mengedarkan dalam tiub interstisial dan renal. Yang penting, kami juga mengesahkan korelasi antara Rplp1/Lgals1 dan BUN/Cr, dan keputusan menunjukkan bahawa Rplp1/Lgals1 pada tahap protein berkorelasi positif dengan BUN/Cr (semua R > 0.5,p < 0.05)="" (gamb.="">

Perbincangan

Peningkatan bukti menunjukkan bahawa AKI akhirnya akan berkembang menjadi CKD/ESRD, dengan insiden yang lebih tinggi [4, 27]. Setakat ini, terdapat terapi terhad pada peralihan dari AKI ke CKD [28-30]. Oleh itu, pemahaman yang lebih baik tentang mekanisme patofisiologi dan pengenalpastian biomarker berpotensi sangat membantu untuk mencegah peralihan ini dan meningkatkan prognosisnya. Dalam kajian ini, kami melakukan WGCNA untuk menganalisis data microarray yang berkaitan dengan peralihan dari AKI ke CKD. Sebanyak 17 modul telah diperolehi, dan 3 modul gen utama telah digunakan untuk analisis selanjutnya. Hasil daripada kajian ini mencadangkan bahawa 3 modul gen berkait rapat dengan

Rajah 4. Pengesahan gen hab dalam modul turquoise. Kuantifikasi ekspresi mRNA Lgals1, Col3a1, Rplp1, Mgp dan Col6a2 oleh Q-PCR. B Western blot digunakan untuk menyiasat ekspresi protein yang ditunjukkan. C Kuantifikasi ekspresi protein dengan mengimbas densitometri. ***p < 0.001="" berbanding="" dengan="" kumpulan="" kawalan.="" d,="" e="" korelasi="" antara="" rplp1/="" lgals1="" dan="" bun/cr="" (semua="" r=""> 0.5,p <>

Rajah 5. Pengesahan lokasi gen hab dalam modul turquoise. A, B Lokasi dan ekspresi Lgals1 dan Rplp1 oleh imunofluoresensi in situ, masing-masing.

perkembangan fibrosis buah pinggang selepas AKI dalam klasifikasi GO, sebagai contoh, pembangunan sistem buah pinggang, perkembangan vaskular buah pinggang [31, 32], beberapa proses metabolik [33, 34], membran dalaman mitokondria, membran dalaman organel, dan ECM [35-37] ]. Ketidakseimbangan ECM adalah punca utama fibrosis buah pinggang. Selepas AKI, fibrosis dipengaruhi oleh pelbagai faktor seperti sel radang terkumpul, myofibroblas yang diaktifkan, dan sebagainya [30, 33]. Oleh itu, kajian ini memfokuskan kepada modul biru kerana modul tersebut berkait rapat dengan ECM.

Seterusnya, kami menapis gen dalam modul turquoise dengan mengira GS, diikuti dengan menjana rangkaian PPI. Daripada rangkaian PPI dalam modul turquoise, dapat disimpulkan bahawa 6 gen S100a6, Col3a1, Col6a2, Mgp, Rplp1, dan Lgals1 memaparkan sambungan tertinggi dengan gen jiran lain dan terletak di tengah-tengah rangkaian PPI. S100a6 dikodkan dengan menjadi ahli keluarga protein S100. Telah dilaporkan dalam kesusasteraan bahawa S100a6 boleh mengawal percambahan sel dan mengambil bahagian dalam proses patologi pengantara imun peralihan epitelium-mesenchymal buah pinggang dan fibrosis [38, 39]. Col3a1 dan Col6a2 masing-masing ialah kolagen jenis III alfa-1 dan kolagen jenis VI alfa-2 rantai. Mereka mengekod kolagen, mengikat kepada protein jentera ekstraselular, dan amat penting dalam komponen matriks sel. Apabila fibrosis berlaku dalam organ seperti hati dan buah pinggang, ekspresi kolagen ini dinaikkan, yang merupakan penunjuk penting untuk menilai kemajuan penyakit dan pemerhatian kesan terapeutik [23, 25]. Mgp, matriks protein Gla, adalah ahli keluarga osteocalcin/Mgp yang dinyatakan selepas CKD dan dikaitkan dengan prognosis buah pinggang [26, 40]. Selaras dengan kajian terdahulu, penyelidikan kami juga mendedahkan bahawa S100a6, Col3a1, Col6a2, dan Mgp adalah penanda diagnostik awal yang berpotensi untuk fibrosis buah pinggang selepas AKI.

Rplp1, gen yang mengekod protein ribosom yang merupakan sebahagian daripada subunit 60S, memainkan peranan penting dalam langkah pemanjangan sintesis protein. Rplp1 sangat dinyatakan dalam pelbagai sel kanser manusia dan kekurangannya akan menjejaskan sintesis protein, yang membawa kepada apoptosis [41, 42]. Lgals1, juga dikenali sebagai Galectin-1, ialah ahli keluarga protein pengikat sisi -galacto- dan memainkan peranan dalam mengawal selia apoptosis, percambahan sel dan pembezaan sel. Lgals1 ialah tempat penyelidikan yang hangat dalam bidang tumor, dan banyak kajian baru-baru ini telah melaporkan bahawa ia juga memainkan peranan penting dalam proses fibrosis organ. Telah ditunjukkan bahawa Lgals1 sangat dinyatakan dalam buah pinggang diabetes jenis I dan jenis II dan merupakan penanda baru fibrosis buah pinggang [43-45]. Walau bagaimanapun, perlu diperhatikan bahawa Rplp1 dan Lgals1 tidak dilaporkan dalam fibrosis buah pinggang selepas AKI. Dalam kajian ini, kami telah membuktikan awal bahawa Rplp1 dan Lgals1 mungkin digunakan sebagai biomarker berpotensi dalam fibrosis buah pinggang selepas AKI oleh bioinformatik dan cara eksperimen. Analisis eksperimen berbilang kami menunjukkan bahawa paparan Lgals1 dan Rplp1 meningkat secara mendadak dalam buah pinggang IRI-AKI dan Cis-AKI, dan ekspresi 2 gen meningkat selepas 3 hari dan menurun selepas 7 hari, yang konsisten dengan keputusan yang dianalisis oleh kaedah bioinformatik WGCNA.

Perlu diingatkan bahawa terdapat beberapa batasan kajian: pertama, bilangan sampel yang digunakan untuk analisis adalah agak tidak mencukupi yang mungkin menghilangkan atau mengurangkan ketepatan analisis. Kedua, gen hab disiasat lebih lanjut hanya dalam model tikus AKI dan bukannya spesimen manusia yang mungkin juga menghalang terjemahan penemuan daripada tetikus kepada manusia. Terdapat banyak kajian tentang LGALS1 dalam kanser manusia, dan ekspresinya meningkat dalam kanser buah pinggang. Menyasarkan LGALS1 boleh menghalang perkembangan tumornya. Walaupun RPLP1 telah ditemui dalam endometriosis, tumor ginekologi, dan penyakit lain, ia tidak dikaji dalam buah pinggang manusia. Penyiasatan lanjut gen hab pada spesimen manusia seperti perkumuhan air kencing mungkin lebih jelas menjelaskan peranan biologi mereka secara klinikal. Kesimpulannya, kajian ini meletakkan asas untuk mengkaji lebih lanjut peranan Rplp1 dan Lgals1 dalam AKI.

cistanche mengagumkanuntukpemulihan buah pinggang

Kesimpulan

Ringkasnya, kajian ini mengenal pasti gen utama yang berkaitan dengan AKI melalui analisis WGCNA, dan secara eksperimen menemui 2 gen hab yang berpotensi untuk penyelidikan lanjut, Rplp1, dan Lgals1. Walau bagaimanapun, mekanisme khusus dalam patogenesis AKI kekal sebagai penyelidikan lanjut. Gen calon kritikal yang dipilih menyediakan arahan penyelidikan baharu untuk pencegahan, diagnosis, rawatan dan prognosis fibrosis buah pinggang.

Pernyataan Etika

Semua haiwan telah dirawat mengikut Garis Panduan Institut Kesihatan Kebangsaan untuk penggunaan dan penjagaan haiwan penyelidikan.

Penyata Konflik Kepentingan

Penulis mengisytiharkan bahawa tidak ada konflik kepentingan.

Sumber Pembiayaan

Kerja ini disokong oleh Luzhou - Projek Platform Bersama Perubatan Barat Daya (2017LZXNYD-P01 dan 2018LZXNYD-PT03), Projek Pembinaan Makmal Perubatan Utama Wilayah Sichuan (2018#53), Projek Sains dan Teknologi Sichuan (2020YJ0442); Geran Khas Bersama Universiti Perubatan Perbandaran Luzhou – Southwest untuk Pengenalan Bakat Peringkat Tinggi (Pasukan Lan Hui-Yao); dan Program Bersama Universiti Perubatan Barat Daya dan Hospital Perubatan Tradisional Gabungan (2018XYLH-029).

Sumbangan Pengarang

Li Wang dan Jianchun Li menyusun dan menyelaraskan kajian itu. Xiao Lin menulis kertas itu. Jianchun Li menyemak kertas itu. Jianchun Li menjalankan analisis bioinformatik. Xiao Lin melakukan eksperimen haiwan dan menjalankan PCR, IHC dan IF masa nyata. Xia Zhong dan Jieke Yang menjalankan WB dan mengumpul sampel buah pinggang tikus. Ruizhi Tan melakukan analisis statistik. Semua pengarang menyemak keputusan dan meluluskan versi akhir manuskrip.

pengalaman suplemen cistanche dalam peraturan fungsi buah pinggang