Tahun Baru, Varian SARS-CoV-2 Baharu: Resolusi Mengenai Protokol Pengawasan Genomik Untuk Menghadapi Omicron

Hubungi:joanna.jia@wecistanche.com/ WhatsApp: 008618081934791

Kemunculan varian SARS-CoV-2 dengan kebolehtransmisian yang dipertingkatkan dan separaimunmelarikan diri (juga dikenali sebagai Varian Keprihatinan, VOC) telah mencirikan tahun kedua pandemik-19 COVID. Pengawasan genomik membolehkan mengenal pasti garis keturunan dan VOC yang tersembunyi dan cepat tersebar sebelum ia menjadi ancaman kesihatan awam. Institut Kesihatan Awam Chile (Instituto de Salud Publica, ISP) telah mengetuai inisiatif pengawasan genomik SARS-CoV-2 di Chile. Menggunakan data penjujukan, ISP telah menandakan pengenalan VOC dan mencirikan kebolehtransmisian dan tandatangan mutasinya, menyumbang kepada pemahaman yang lebih baik tentang ciri-ciri tempatan wabak itu.1

cistanche propiedades: separaimunmelarikan diri

Sehingga 17 Dis 2021, Omicron VOC yang baru muncul telah merebak dengan cepat ke 89 negara, termasuk Chile.2 Menjelang 21 Dis, ISP telah mengenal pasti 119 sampel sebagai Omicron. Daripada jumlah ini, 118 sepadan dengan ketibaan di lapangan terbang SCL dan satu kepada penghantaran komuniti (Rajah 1a, b). Walaupun ciri epidemiologi Omicron masih dalam kajian, laporan semasa mencadangkan dua fakta yang membimbangkan: Pertama, Omicron mempunyai pelarian yang meluas daripada peneutralan semula jadi dan yang ditimbulkan oleh vaksin, sekali gus meningkatkan peluang jangkitan semula dan jangkitan terobosan.

faedah cistanche salsa

Secara khusus,Kebal Omicronmelarikan diri akan mengurangkan keberkesanan vaksin terhadap penyakit bergejala kepada 35 peratus dan 73 peratus untuk 2x individu yang baru divaksin dan dirangsang, masing-masing, memandangkan vaksin mRNA (BNT162b2 Pfifizer-BioNTech).3 Selain itu, perlindungan terhadap jangkitan ini nampaknya berkurangan dalam beberapa bulan dan kadar melarikan diri adalah lebih tinggi untuk penggalak BNT162b2 heterolog dalam individu yang divaksin sepenuhnya dengan vaksin virus Sinovac yang tidak diaktifkan, CoronaVac.4,5 Walaupun pada 9 Jan 2022, 86.6 peratus daripada populasi Chile telah divaksin sepenuhnya dan 60.5 peratus telah mendapat pukulan penggalak6 (Rajah 1c), kebanyakan dos yang diberikan sepadan dengan CoronaVac (55.3 peratus ) diikuti oleh BNT162b2 (36.4 peratus , biasanya penggalak),7 sekali gus mempertaruhkan gelombang lain.4

suplemen anthocyanin & suplemen cistanche

Kedua, pada mulanya dan tanpa adanya NPI baharu, Omicron mencapai masa penggandaan selama 1.5- 3 hari,8 dengan itu merebak lebih cepat daripada Delta VOC. Walau bagaimanapun, ini lebih baik dijelaskan oleh Omicron's ekstensifimunmelarikan diri daripada peningkatan yang wujud dalam kebolehtransmisian asas.9 Oleh itu, NPI yang lebih ketat boleh mengurangkan penghantaran dengan ketara. Walaupun perlindungan terhadap penyakit yang teruk nampaknya kekal untuk jangkitan Omicron, insiden yang tinggi dalam kalangan penduduk membahayakan fungsi infrastruktur kritikal yang betul, kerana sebahagian besar tenaga kerja memerlukan ujian dan kuarantin. Oleh itu, adalah asas untuk membuat keputusan termaklum untuk menentukan varian dan sifat yang beredar melalui pengawasan genomik.

Walaupun pengawasan genomik memberikan gambaran bagi varian yang beredar dan tandatangan mutasinya, kebolehpercayaannya bergantung pada kualiti protokol pensampelan. Dalam perkara berikut, kami meringkaskan syor rasmi untuk pengawasan genomik10 kepada empat peraturan mudah untuk dipertimbangkan untuk protokol pensampelan yang teguh untuk pengawasan genomik-2 SARS-CoV: peraturan CARD:

1. Diselaraskan: Usaha daripada entiti yang berbeza harus diarahkan dan diselaraskan secara berpusat untuk mengelakkan bias pemilihan, memastikan keterwakilan, mengoptimumkan peruntukan sumber dan menyeragamkan protokol pensampelan. Entiti ini juga harus memastikan ketelusan protokol pensampelan, yang harus dilaporkan bersama maklumat genom kepada GISAID.

2. Adaptif: Keamatan penjujukan harus ditingkatkan untuk memberikan resolusi yang lebih baik apabila varian baharu diisyaratkan pada POE dan dikesan dalam penghantaran komuniti dan dikurangkan kepada kadar asasnya apabila dominasi varian dipastikan. Dengan berbuat demikian, pembuat dasar boleh bertindak secara pencegahan (rujuk Rajah 1d).

3. Perwakilan: Protokol pensampelan harus menangkap heterogeniti spatial, menyasarkan kepada kumpulan etnografi yang berbeza, mengambil kira kecenderungan pelanggar yang berpotensi (cth, sebagai pensampelan hanya individu yang bergejala, atau tidak divaksinasi, atau daripada rantaian penularan yang sama), dan berkadar dengan kejadian semasa kepada mengekalkan keterwakilan. Di negara seperti Chile, di mana pusat bandar diagihkan dengan jarang, keterwakilan mesti terjamin pada asas serantau.

4. Perbezaan: Sampel yang dikumpul di (i) tempat masuk (POE) dan (ii) pusat pengawasan harus ditangani dan dianalisis secara berasingan, kerana ia mempunyai tujuan yang berbeza. Sebaik sahaja ancaman baru dikesan di POE, pensampelan komuniti harus ditingkatkan supaya dinamik penggantian awal antara varian ditangkap dengan tepat.

Memandangkan kami telah pun mengesan Omicron dalam penghantaran komuniti, pembuat dasar Chile harus menyesuaikan secara dinamik keketatan campur tangan bukan farmaseutikal untuk mencegah penyebarannya sambil menawarkan vaksin mRNA penggalak kepada pecahan yang lebih besar daripada populasi.11 Pada peringkat ini, pengawasan genomik adalah penting untuk kesediaan dan penggubal dasar bukan sahaja bertujuan untuk melayari ombak tetapi juga belajar daripadanya. Secara keseluruhannya, kami mempunyai peluang yang lebih besar untuk berjaya jika kami memainkan KAD kami dengan betul.

meningkatkan imuniti denganubat-ubat herba

Rujukan

1 Atau ostica KY, Contreras S, Mohr SB, et al. Tandatangan mutasi dan kebolehtransmisian varian SARS-CoV-2 Gamma dan Lambda. pracetak arXiv arXiv:2108.10018. 2021.

2 Viana R, Moyo S, Amoako DG, et al. Peluasan wabak yang pantas bagi varian SARS-CoV-2 Omicron di selatan Afrika. alam semula jadi. 2022.

3 Cele S, Jackson L, Khoury DS, et al. Omicron secara meluas tetapi tidak sepenuhnya terlepas daripada peneutralan Pfifizer BNT162b2. alam semula jadi. 2021.

4 Perez-Then E, Lucas C, Monteiro VS, et al. Imunogenisiti penggalak BNT162b2 heterolog dalam individu yang divaksin sepenuhnya dengan CoronaVac terhadap varian SARS-CoV-2 Delta dan Omicron: Pengalaman Republik Dominican. medRxiv. 2021.

5 Lu L, Mok BW, Chen L, et al. Peneutralan varian SARS-CoV-2 Omicron oleh sera daripada penerima vaksin BNT162b2 atau Coronavac. Clin Infect Dis. 2021:ciab1041.

6 Mathieu E, Ritchie H, Ortiz-Ospina E, et al. Pangkalan data global vaksinasi COVID-19. Nat Hum Behav. 2021:1–7.

7 168 degree informe epidemiologico, informe incidencia y gravedad de Casos covid-19 segun antesedentes de Vacunacion e informe Estra tegia Nacional de Tta [Internet]. Departamento de Estadisticas e Informacion de Salud. [dipetik 2022Jan13].

8 Torjesen I. Sekatan Covid diperketatkan kerana kes Omicron berganda setiap dua hingga tiga hari. BMJ. 2021;375:n3051

9 Lyngse FP, Mortensen LH, Denwood MJ, et al. SARS-CoV-2 Omi cron VOC transmisi dalam isi rumah Denmark. medRxiv. 2021 Dis.

10 Pertubuhan Kesihatan Sedunia. Panduan untuk pengawasan varian SARS CoV-2. Bimbingan sementara. [Internet] 9 Ogos 2021.

11 Bauer S, Contreras S, Dehning J, et al. Sekatan yang melonggarkan pada kadar vaksinasi meningkatkan kebebasan dan melindungi daripada gelombang-19 COVID yang lebih lanjut. PLoS Comput Biol. 2021;17:(9) e1009288