Meneroka Mekanisme Tindakan Jumlah Glikosida Cistanche Pada Penyakit Usus Radang Berdasarkan Rangkaian Farmakologi Dan Eksperimen Haiwan Ⅲ

3 Keputusan dan analisis

3.1 Analisis sasaran jumlah glikosida dan sasaran penyakit Cistanche tubulosa

Import fail struktur tiga dimensi bagibahan-bahan aktifke dalam pangkalan data PharmMapper untuk mendapatkan mata sasaran yang sepadan yang sepadan dengan ramuan yang berbeza. Pangkalan data UniProt digunakan untuk mendapatkan maklumat nama protein dan nama gen yang sepadan dengan setiap sasaran. Menggabungkan mata sasaran sepadan dengan tujuh komponen, sebanyak 354 sasaran diperolehi. Dalam pangkalan data GeneCards, gen yang berkaitan telah dicari menggunakan kata kunci "penyakit radang usus", dan hasil carian telah diisih, dan 7851 sasaran akhirnya diperoleh. Gunakan peristiwa untuk melukis gambar rajah Venn dalam talian untuk mendapatkan persilangan sasaran bahan aktif Cistanche tubulosa dan titik sasaran IBD. Seperti yang ditunjukkan dalam Rajah 1, 254 sasaran bahan aktif bagiCistanche tubulosayang mempunyai kesan perlindungan terhadap IBD telah diperolehi.

Rajah.2 Gambar rajah rangkaian PPI bagi sasaran biasa

Rajah.5 Rangkaian laluan komponen-sasaran

Rajah 7 Jumlah glikosida bagi Cistanche tubulosa mengurangkan kawalan mRNA bagi laluan isyarat TGF- dan mTOR dalam tikus IBD

3.4 Jumlah glikosida cistanche tubulosa meningkatkan skor DAI yang disebabkan oleh DSS

Keputusan ujian menunjukkan bahawa, kecuali untuk kumpulan CZ, tiga kumpulan lain mempunyai tahap penurunan berat badan yang berbeza-beza dan darah ghaib najis (Rajah 6). Antaranya, kumpulan kawalan DSS mempunyai kadar penurunan berat badan yang paling tinggi, darah najis paling teruk, DAI tertinggi, dan pendarahan najis yang jelas pada hari ke-6. Selepas campur tangan jumlah glikosida Cistanche tubulosa, skor DAI secara beransur-ansur menurun, dan keadaan darah ghaib secara beransur-ansur menurun. Kumpulan HZ mempunyai kadar penurunan berat badan yang paling rendah dan jumlah darah tersembunyi yang paling rendah dalam najis. Keputusan menunjukkan bahawa jumlah glikosida Cistanche tubulosa meningkatkan tindak balas fisiologi yang disebabkan oleh penyakit radang usus.

TAMBAHAN CISTANCHE UNTUK RAWATAN IBD PHGS75% ECH 30% ACT 12%

3.5 Jumlah glikosida cistanche tubulosa turun-mengawal IBD

Ungkapan laluan isyarat mTOR dan TGF dalam limpa tetikus mTOR dan laluan isyarat TGF adalah dua laluan isyarat penting yang mengaktifkan tindak balas keradangan. Ekspresi mTOR dan TGF- dalam tisu limpa tikus dikesan oleh qRT-PCR. Keputusan menunjukkan bahawa ekspresi mRNA mTOR dan TGF- dalam tikus kumpulan kawalan DSS meningkat dengan ketara berbanding dengan tikus biasa. Berbanding dengan tikus kawalan DSS, Berbanding dengan Cistanche tubulosa, ekspresi mTOR dan TGF- pada tikus berkurangan dengan ketara selepas campur tangan Cistanche tubulosa. Antaranya, kumpulan dos tinggi mempunyai penurunan yang paling ketara, dan tahap ekspresi pada dasarnya konsisten dengan kumpulan normal (Rajah 7). Keputusan menunjukkan bahawa jumlah glikosida Cistanche tubulosa merendahkan ekspresi laluan isyarat mTOR dan TGF-.

Rajah.8 Peta haba bagi pengelompokan kelimpahan fungsi PICRUSt2-

3.6 Analisis anotasi fungsi PICRUSt2

PICRUSt2 ialah alat bioinformatik untuk meramalkan fungsi metagenomik berdasarkan rRNA 16S biologi, pokok ASV, dan maklumat gen ASV dalam pangkalan data Greengene. Pilih pangkalan data COG digunakan untuk ramalan berfungsi, dan keputusan menunjukkan bahawa fungsi flora usus terutamanya melibatkan pemprosesan RNA; struktur dan dinamik kromatin; kawalan kitaran sel, pembahagian sel, pembahagian kromosom; mekanisma pertahanan; mengisyaratkan dinding sel/membran sel/biogenesis sampul; sel Ia mempunyai lebih daripada 20 fungsi seperti struktur ekstraselular; pengangkutan intraselular, rembesan, dan pengangkutan vesikel; pengeluaran dan penukaran tenaga; pengangkutan karbohidrat dan metabolisme. Pilih 15 ciri yang paling banyak dan maklumat kelimpahannya dalam setiap sampelPeta haba (Rajah 8) dilukis untuk maklumat dan dikelompokkan daripada tahap fungsi yang berbeza.

Berbanding dengan kumpulan CZ, tikus kumpulan kawalan DZ mempunyai COG1132 (sistem pengangkutan multidrug jenis ABC), COG0745 (pengawal selia tindak balas pengikat DNA), COG1131 (sistem pengangkutan pelbagai ubat jenis ABC), COG1961 (Recombinase DNA khusus tapak berkaitan dengan Pin invertase DNA ), COG0438 (Glycosyltransferase terlibatdalam biosintesis dinding sel), COG0534 (Na +-didorongpam eflux multidrug), COG0642 (Kinase histidine transduksi isyarat), COG1595 (subunit sigma khusus polimerase RNA terarah DNA), COG0463 (Endonuclease), COG4974 (Recombinase khusus tapak XerD), COG2207 (domain AraC dan jenis AraC pengikat). mengandungi protein), COG1136 (sistem eksport lipoprotein jenis ABC), dan COG1309 (pengawal selia transkrip pengikat DNA) keabnormalan ekspresi gen berfungsi. Gen ini terlibat terutamanya dalam: V: mekanisme pertahanan; T: mekanisme transduksi isyarat; M: dinding sel/membran sel/biogenesis sampul; I: pengangkutan lipid dan metabolisme; K: transkripsi; L: replikasi, penggabungan semula dan pembaikan.

Selepas enam fungsi ini diberi jumlah glikosida Cistanche tubulosa, ekspresi fungsi fisiologi yang berbeza ini hampir dengan kumpulan normal. Berbanding dengan tikus dalam kumpulan CZ dan DZ, tikus dalam kumpulan HZ mempunyai gen COG1028 (keluarga dehidrogenase alkohol rantai pendek) dan COG0451 (Nucleoside-phosphate-sugar epimerase) yang tinggi. Kedua-dua gen ini berkaitan dengan I: pengangkutan lipid dan metabolisme. Dan M: Fungsi biogenesis dinding sel/membran sel/sampul berkait rapat. Oleh itu, spekulasi bahawa jumlah glikosida Cistanche tubulosa boleh mengawal kerosakan tikus IBD dengan mengawal metabolisme lipid, metabolisme glukosa dan mekanisme transduksi isyarat pertahanan yang berkaitan pada tikus.