Penyiasatan Pengiraan Derivatif Benzalacetophenone Terhadap SARS-CoV-2 Sebagai Potensi Sebatian Bioaktif Berbilang Sasaran Ⅱ

3.7.2. Kestabilan kompleks 3CLpro-carmofur

Kompleks 3CLpro-carmofur menunjukkan dinamik yang stabil semasa 15{12}} ns simulasi selepas tempoh penyamaan (60 ns). Nilai RMSD purata untuk tulang belakang dan kompleks ialah 2.34 Å dan 2.81 Å, masing-masing. Sisa terminal N dan C menunjukkan turun naik baki maksimum (~10 Å). Walau bagaimanapun, sisa yang terlibat dalam interaksi tidak terikat yang stabil dan terpelihara menunjukkan turun naik yang agak lebih rendah (~ 2.0 Å). Nilai Rg mendedahkan corak lipatan semasa ~30 ns (Rajah 10) dan didapati menyatakan pembahagian separa yang menunjukkan pengikatan ligan yang stabil. Di samping itu, diperhatikan bahawa purata luas permukaan awal dan akhir yang diduduki oleh kompleks dok 3CLpro dan carmofur ialah 145.97 nm2 dan 148.49 nm2 masing-masing. Purata kawasan permukaan hidrofobik yang diduduki oleh kompleks adalah 148.32 nm2 yang mewakili protein terbentang dan fleksibiliti poket pengikat. Filem tambahan (S2) mewakili mod pengikatan terperinci dan dinamik stabil carmofur kepada 3CLpro. Kompleks ini membentuk 6 stabilH-ikatan yang mana 4 adalah konsisten sepanjang simulasi. Ia dipercayai bahawa ini stabilH-interaksi ikatan menggalakkan pembentukan kompleks yang stabil. Anggaran tenaga pengikat relatif kompleks 3CLpro-carmofur kompleks ialah− 16.67 kcal/mol. Selanjutnya, sisa-sisa utama yang menyumbang kepada tenaga pengikat telah dikenal pasti dengan mengira setiap tenaga penguraian sisa. Sisa-sisaThr25, Met49, Cys142, Met165, Leu167, Arg188,danGln189menyukai pembentukan kompleks yang stabil. Walau bagaimanapun, sisaAsn142danGlu166tidak memihak kepada interaksi. Di antara sisa-sisa ini,Met165menunjukkan sumbangan yang ketara kepada tenaga pengikat kerana ia mempunyai tenaga sumbangan yang paling sedikit (− 9.12 kJ/mol). Walau bagaimanapun, tenaga sumbangan untuk sisa berinteraksi lain berbeza antara− 1.42 hingga− 5.601 kJ/mol dan turut mengambil bahagian dalam pembentukan kompleks yang stabil.

3.7.3. Kestabilan kompleks PLpro - 4-hydroxycordoin (c30).

Kompleks PLpro–4-hydroxycordoin (c30) menunjukkan dinamik yang stabil dan arah aliran yang serupa sepanjang 150 ns. Nilai RMSD adalah stabil sehingga ~80 ns daripada ~1.2 hingga ~1.5 Å dan ~1.8 hingga ~2.2 Å untuk tulang belakang dan kompleks, masing-masing. Selepas ~ 80 ns, RMSD didapati lebih tinggi (~ 1.5-2.3 Å dan ~ 2.2 hingga 3.5 Å, masing-masing) disebabkan oleh peningkatan luas permukaan protein. Sisa turun naik yang diplot untuk C menunjukkan pembentukan sesentuh tidak terikat yang stabil dalam sisa dengan turun naik yang lebih sedikit diperhatikan dalam 4-hydroxycordoin (c30) iaitu Val203, Met207, Tyr208, Met209, Ile223, Pro224 dan Pro248 yang lain. sisa tidak berinteraksi. Nilai Rg menunjukkan pembentukan kompleks yang stabil semasa simulasi MD dengan membentuk bentuk globular padat seperti yang ditunjukkan oleh penurunan yang stabil dalam nilai Rg. Filem tambahan (S3) mempersembahkan mod pengikatan 4-hydroxycordoin (c30) dengan PLpro. Telah diperhatikan bahawa gelung yang terbentuk oleh sisa antara dua helaian adalah dekat dengan poket pengikat dan mempunyai sentuhan maksimum dengan molekul. Walau bagaimanapun, disebabkan sifat fleksibel gelung ini, ia menunjukkan pembukaan poket pengikat yang mengakibatkan peningkatan pergerakan SASA dan ligan semasa simulasi MD selepas ~ 85 ns. Luas permukaan awal dan akhir yang diduduki oleh kompleks dok PLpro dan 4-hydroxycordoin (c30) ialah 169.50 nm2 dan 170.29 nm2 masing-masing. Purata kawasan permukaan yang diduduki oleh kompleks ialah 170 nm2 . Kompleks itu membentuk 3 ikatan H yang mana 2 daripadanya konsisten. Perkaitan pengikatan hidroksikordoin 4- (c30) dengan PLpro dianggarkan dengan mengira tenaga pengikatan relatif. Kompleks menunjukkan tenaga pengikat -16.28 kcal/mol. Untuk mendapatkan lebih banyak gambaran struktur mengenai sumbangan sisa individu dalam tenaga pengikat, tenaga penguraian sisa dianalisis. Diperhatikan bahawa 7 residu menyumbang dengan ketara kepada pembentukan kompleks yang stabil dan menggemari interaksi tidak terikat sedia ada iaitu Val203, Met207, Tyr208, Met209, Ile223, Pro224, dan Pro248 (Rajah 11). Paling penting, sisa Tyr208, Met209, Ile223, dan Pro224 menunjukkan sumbangan yang ketara kepada pertalian mengikat dengan menjaringkan tenaga sumbangan terendah masing-masing - 2.97, - 3.89, - 3.82, dan - 2.91 kJ/mol. Video tambahan yang berkaitan dengan artikel ini boleh didapati di https://d oi.org/10.1016/j.compbiomed.2022.105668.

3.7.4. Kestabilan kompleks PLpro-GRL-0617.

Kompleks PLpro-GRL-0617 adalah stabil dan mempamerkan nilai RMSD yang serupa sehingga 120 ns. Nilai RMSD untuk tulang belakang berjulat dari ~1.3 Å hingga ~3.0 Å dan ~1.8 Å hingga ~4.5 Å untuk kompleks. Penurunan stabil dalam nilai RMSD tulang belakang diperhatikan selepas ~120 ns (dari ~3.{{20}} Å kepada 2.0 Å) dan kekal stabil sepanjang Tempoh simulasi MD (150 ns). Begitu juga, nilai RMSD kompleks menunjukkan penurunan stabil yang serupa dalam nilai RMSD antara ~4.5 Å hingga ~3.0 Å. Selepas ~120 ns, nilai RMSD terus meningkat sehingga 3.8 Å hingga 150 ns. Turun naik baki Gly164, Asp165, Thr211, Leu212, Asn216, Ile223, Ala247, Pro248 dan Tyr265 secara relatifnya kurang berbanding dengan sisa tidak berinteraksi yang lain. Walaupun Cys225, Val226, dan Cys227 menunjukkan turun naik baki maksimum sehingga 6 Å disebabkan oleh peningkatan fleksibiliti tempatan, interaksi ligan diperhatikan semasa simulasi. Selanjutnya, nilai Rg menunjukkan pembentukan kompleks yang stabil sehingga ~ 70 ns. Di samping itu, disebabkan oleh fleksibiliti kawasan gelung bersebelahan dengan poket pengikat ligan "Lys158 hingga Val166", pergerakan ligan diperhatikan ke arah poket pengikat lain (filem tambahan S4) yang juga dibuktikan dengan peningkatan nilai Rg ~70 NS. Selain itu, GRL-0617 membentuk kenalan tidak terikat yang stabil sepanjang simulasi MD 150 ns seperti yang disokong oleh corak Rg yang stabil. Pada mulanya, SASA menunjukkan poket pengikat yang fleksibel dan peningkatan nilai SASA. Ini mungkin telah mencetuskan orientasi semula ligan GRL- 0617. Kawasan permukaan awal dan akhir yang diduduki oleh kompleks berlabuh PLpro dan GRL- 0617 masing-masing dicatatkan sebagai 164.32 nm2 dan 162.263 nm2. Purata kawasan permukaan yang diduduki oleh kompleks ini ialah 165.02 nm2 . Begitu juga, nilai SASA yang meningkat menunjukkan pembukaan poket pengikat untuk pembentukan kompleks yang stabil yang digemari terutamanya disebabkan oleh sifat fleksibel sisa poket pengikat. Kompleks membentuk 4 ikatan H yang mana 2 ikatan H adalah konsisten semasa tempoh simulasi. Selanjutnya, kompleks PLpro-GRL-0617 menunjukkan tenaga mengikat -11.83 kcal/mol. Di samping itu, pandangan struktur ke dalam sumbangan sisa individu dalam tenaga pengikat dikira dengan mengira tenaga penguraian setiap sisa. Diperhatikan bahawa 9 sisa mempunyai sumbangan penting kepada pembentukan kompleks yang stabil dan menyukai interaksi tidak terikat sedia ada iaitu Thr211, Leu212, Asn216, Ile223, Cys225, Val226, Cys227, Ala247, dan Pro248 (Rajah 12). Paling penting, sisa Ile223, Cys225, Val226, dan Cys227 menunjukkan sumbangan ketara dalam pertalian pengikatan dengan menjaringkan tenaga sumbangan terendah masing-masing - 0.91, - 0.74, - 1.86, dan -1.08 kJ/mol. .

Video tambahan yang berkaitan dengan artikel ini boleh didapati di https://d oi.org/10.1016/j.compbiomed.2022.105668.

Rajah 5. Analisis GO bagi protein terkawal oleh derivatif benzalacetophenone yang mempersembahkan komponen selular, fungsi molekul dan proses biologi.

3.7.5. Kestabilan protein spike - kompleks mallotophilippen D (c42).

Kompleks protein-mallotophilippen D (c42) spike menunjukkan dinamik yang stabil selepas tempoh keseimbangan 100 ns serupa dengan kompleks lain yang dikaji. Nilai RMSD berbeza-beza antara ~1.2 Å hingga 3 Å dan 1.8 Å hingga ~4 Å untuk tulang belakang dan kompleks, masing-masing. Simulasi dilanjutkan lagi kepada 200 ns kerana kompleks ini mencapai keadaan keseimbangan selepas 100 ns. Purata nilai RMSD tulang belakang dan kompleks yang diperhatikan ialah ~2.6 Å dan ~3.8 Å, masing-masing. Baki turun naik yang diplot untuk C , mendedahkan turun naik yang lebih sedikit untuk sisa yang mengambil bahagian dalam hubungan tidak terikat dengan mallotophilippen D (c42) berbanding dengan sisa tidak berinteraksi yang lain. Walau bagaimanapun, rantau gelung fleksibel yang dibentuk oleh sisa Alal344-Trp353 dan Glu516-Thr523 adalah sangat dinamik dan menunjukkan turun naik yang lebih tinggi (~3 Å). Sisa yang terlibat secara aktif dalam interaksi ligan-protein termasuk Phe342, Leu368, dan Ile434 menunjukkan turun naik paling sedikit (filem tambahan S5). Selanjutnya, kompleks yang stabil telah dibentuk semasa simulasi MD dan membentuk bentuk globular padat seperti yang ditunjukkan oleh penurunan nilai Rg selepas 10 ns. Kompleks ini mengikuti nilai Rg yang stabil selepas 100 ns menunjukkan lipatan yang betul yang diperlukan untuk membentuk kompleks yang stabil antara ligan dan protein. Kawasan permukaan awal dan akhir yang diduduki oleh protein spike dan kompleks berlabuh mallotophilippen D (c42) masing-masing ialah 112.38 nm2 dan 112.6 nm2. Purata kawasan permukaan yang diduduki oleh kompleks ialah 111.4 nm2 . Filem tambahan (S5) menunjukkan mod pengikatan terperinci mallotophilippen D (c42) dengan protein spike. Kompleks tersebut membentuk 6 ikatan H yang mana 3 daripadanya adalah konsisten. Perkaitan pengikatan mallotophilippen D (c42) kepada protein spike dianggarkan dengan mengira tenaga pengikat relatif. Di samping itu, kompleks menunjukkan tenaga mengikat -34.10 kcal/mol. Selanjutnya, tenaga sumbangan setiap sisa mendedahkan 12 sisa daripada poket pengikat iaitu Phe342, Ala363, Asp364, Tyr365, Leu368, Leu371, Ala372, Phe374, Ile434, Trp436, Val511, dan Leu513 untuk menyumbang dengan ketara dalam pembentukan (Fig. 13). Sisa Phe342, Leu368, Ile434, dan Trp436 daripada poket pengikat menunjukkan sumbangan yang ketara kepada pertalian pengikatan dengan menjaringkan tenaga penguraian/sumbangan sisa terkecil masing-masing - 5.78, - 9.39, - 4.71, dan − kJ/4.

Rajah 7. Diramalkanspektrum anti-virusderivatif benzalacetophenone terhadap pelbagai virus. Telah diramalkan bahawa majoriti derivatif benzalacetophenone aktif terhadap virus Herpes (12.57 peratus ) dan paling sedikit terhadap Trachoma (0.57 peratus ).

3.7.6. Kestabilan protein spike - kompleks DRI-C23041

Kompleks spike protein-DRI-C23041 juga menunjukkan dinamik yang stabil selepas tempoh keseimbangan 100 ns serupa dengan kompleks protein mallotophilippen D (c42) spike. Pada mulanya, nilai RMSD tulang belakang dan kompleks meningkat secara beransur-ansur daripada ~1.8 Å kepada 5 Å dan ~2 Å kepada ~5.1 Å masing-masing untuk tulang belakang dan kompleks. Sisa Val367, Leu368, Asp339, Asp364, Asp389, dan Leu441 menunjukkan turun naik yang agak sedikit (~4.0 Å) kerana mereka mengambil bahagian dalam interaksi tidak terikat yang stabil dengan DRI-C23041. Gelung fleksibel yang dibentuk oleh sisa Ala475 hingga Asn487 menunjukkan turun naik baki maksimum (~11.0 Å). Di samping itu, kompleks yang stabil dibentuk oleh nilai Rg yang stabil ~ 18 Å. Di samping itu, putaran lawan arah jam ligan diperhatikan pada kira-kira ~ 63 ns apabila terbentang separa kompleks yang juga dibuktikan oleh peningkatan nilai Rg kepada 19.5 Å (filem tambahan S6). Walau bagaimanapun, ligan memperoleh semula kedudukan asalnya dan menduduki konformasi yang stabil, dan kompleks membentuk bentuk globular padat seperti yang disokong oleh penurunan nilai Rg kepada 18.3 Å. Peralihan struktur ligan ini memihak kepada pembentukan kompleks yang stabil semasa simulasi MD 150 ns. Kawasan permukaan awal dan akhir yang diduduki oleh protein spike dan kompleks berlabuh DRI-C23041 ialah 109.379 nm2 dan 107.334 nm2. Purata kawasan permukaan yang diduduki oleh kompleks ini ialah 110.57 nm2 . Kompleks tersebut membentuk 4 ikatan H yang mana 2 daripadanya konsisten. Tenaga pengikat relatif antara DRI-C23041 kepada protein spike didapati - 3.10 kcal/mol. Tenaga sumbangan setiap sisa mendedahkan 11 sisa daripada poket pengikat iaitu Asp339, Glu340, Asp364, Asp389, Asp398, Asp405, Glu406, Asp427, Asp428, Asp442, dan Glu516 untuk menyumbang secara signifikan dalam membentuk kompleks stabil (Rajah) dan g ini. residu mendapat markah paling sedikit bagi setiap sisa tenaga penguraian/ sumbangan yang berbeza dari -11.90 kJ/mol hingga -27.17 kJ/mol masing-masing.

3.7.7. Komponen utama dan matriks korelasi silang dinamik

Kami melakukan analisis komponen utama untuk meneroka fleksibiliti konformasi dan kepelbagaian konformasi yang muncul daripada trajektori stabil yang diperoleh daripada simulasi MD 150 ns iaitu 100-150 ns untuk lima kompleks dan 150-200 ns untuk kompleks D protein-mallotophilippen spike. Pergerakan kolektif maksimum ditangkap oleh 10 vektor eigen/komponen utama yang pertama. Oleh itu, kami dengan tepat mengkaji dua vektor eigen/PC (komponen utama) pertama secara terperinci. Rajah 15 mewakili unjuran 2D bagi dua vektor eigen pertama. Telah diperhatikan bahawa molekul piawai yang digunakan dalam kajian ini iaitu Carmofur, GRL-0617, dan DRI-C23041, menyasarkan 3CLpro, PLpro, dan protein spike, masing-masing menunjukkan kepelbagaian konformasi yang lebih besar semasa simulasi (ditunjukkan sebagai garis merah dalam Rajah 15A–C) Walau bagaimanapun, ligan terpilih iaitu 3'-(3-metil-2-butenyl)-4′ -O- -D-glucopyr anosyl{{22} },2′-dihydroxychalcone, 4-hydroxycordoin, dan mallotophilippen D yang menyasarkan 3CLpro, PLpro, dan spike protein, masing-masing menunjukkan kurang kepelbagaian konformasi semasa simulasi. Ini mendedahkan bahawa kompleks 3'-(3-metil-2-butenyl)-4′ -O- -D-glucopyranosyl-4,2′ -dihydroxychalcone dengan 3CLpro, 4-hydroxycordoin dengan PLpro dan mallotophilippen D dengan protein spike diseimbangkan dan distabilkan dengan baik semasa simulasi. Di samping itu, ruang konformasi yang lebih besar yang diduduki oleh kompleks (molekul standard) mempamerkan fleksibiliti konformasi yang lebih tinggi dengan bilangan maksimum pembentukan konformasi yang pelbagai. Menariknya, sebatian 3'-(3-metil-2-butenyl)-4′ -O- -D-glucopyranosyl-4,2′ -dihydroxychalcone, {{ 51}}hydroxycordoin, dan mallotophilippen D dengan 3CLpro, PLpro, dan protein spike menduduki ruang konformasi yang agak kurang berbanding dengan kawalan/standard masing-masing. Oleh itu, kami mencadangkan bahawa molekul yang disaring boleh menjadi lebih berkesan daripada ubat standard (Rajah 15D–F).

Korelasi silang dinamik atom C yang diperhatikan dalam kompleks memperoleh lebih banyak gambaran struktur ke dalam gerakan kolektif domain pengikat ligan. Rajah 16 mewakili gerakan sisa bersepadu bagi atom C dalam semua kompleks simulasi. Garisan berwarna kuning ambar pepenjuru menunjukkan korelasi diri yang kuat bagi setiap sisa dengan dirinya sendiri. Amplitud korelasi kepada antikorelasi masing-masing berskala daripada ambar kepada warna biru. Dalam kompleks 3'-(3-metil-2-butenyl)-4′ -O- -D glucopyranosyl-4,2′ -dihydroxy chalcone-3 CLpro, sisa tapak pengikat menunjukkan anti-korelasi dengan domain N-terminal 3CLpro. Walau bagaimanapun, amplitud antikorelasi adalah sederhana manakala kompleks 3CLpro-carmofur (standard) menunjukkan antikorelasi yang sama dengan amplitud yang lebih rendah. Oleh itu, kami mencadangkan pengikatan 3'-(3-metil-2-butenyl)- 4′ -O- -D-glucopyranosyl-4,2′ -dihydroxychalcone yang akan memihak kepada peralihan konformasi dan menggalakkan pembentukan kompleks yang stabil dengan interaksi tidak terikat yang dipertingkatkan berbanding molekul piawainya iaitu carmofur. Begitu juga, satu lagi kompleks 4-hydroxycordoin PLpro menunjukkan korelasi yang kuat antara sisa 50–175, walau bagaimanapun, sisa yang sama dalam kompleks dengan GRL ubat standard-0617 yang terikat pada PLpro menunjukkan gerakan kerjasama yang agak lemah. Pergerakan koperasi yang dinyatakan oleh sisa poket mengikat antara 175 hingga 240 dengan kawasan terminal-N mendedahkan kepentingan sisa tapak aktif dalam menstabilkan kompleks GRL-0617-PLpro. Korelasi poket yang mengikat telah hilang dalam GRL-0617-PLpro kompleks. Molekul standard DRI-C23041-kompleks protein spike menunjukkan gerakan kerjasama yang kuat untuk residu 390 hingga 470 dengan dirinya sendiri, manakala residu ini dalam kompleks spike-mallotophilippen D menunjukkan anti-koperasigerakan. Selain itu, kompleks D spike-mallotophilippen menunjukkan antigerakan koperasi kecuali korelasi diri yang kuat yang dinyatakan oleh semua sisa.

Oleh itu, matriks korelasi silang dinamik menunjukkan gerakan koperasi dan anti-koperasi dalam protein yang menonjolkan fleksibiliti konformasi kompleks yang dikaji dan interaksi tidak terikat yang stabil yang dirawat oleh gerakan bukan koperasi pada bahagian bertentangan mencetuskan pembukaan dan penutupan poket pengikat. sisa yang memudahkan pembentukan kompleks yang stabil semasa simulasi MD.

Rajah 9. Parameter yang menerangkan 3CLpro-3'-(3-metil-2-butenyl)-4′-O- -D-glucopyranosyl-4, Kestabilan struktur kompleks 2'-dihydroxychalcone. (a) RMSD tulang belakang dan kompleks, (b) RMSF, (c) Rg, (d) SASA, (e) bilangan interaksi ikatan-H, dan (f) plot tenaga sumbangan yang menonjolkan kepentingan sisa poket yang mengikat dalam pembentukan kompleks yang stabil.

Jadual 6

Pengiraan MM-PBSA bagi tenaga bebas pengikat dan tenaga interaksi kompleks teratas.

4. Perbincangan

Telah ditunjukkan bahawa penggalak imun boleh memainkan peranan utama dalam profilaksis terhadap pelbagai wabak berjangkit termasuk COVID-19 kerana ia lebih lazim dalam imuniti yang terjejas. Sebelum ini, peranan penggalak imun dalam menangani COVID-19 telah dijelaskan menggunakan pendekatan cheminformatics dan bioinformatics [34]. Begitu juga, kerja ini cuba menyiasat benzalacetophenones (prekursor flavonoid) [35] sebagai penggalak imun dan agen anti-virus terhadap novel coronavirus.

Pada mulanya, sebatian telah diambil dan tertakluk kepada ramalan ness seperti dadah berdasarkan berat molekul, penderma ikatan H, penerima, dan lipofilis seperti yang dijelaskan oleh peraturan lima Lipinski. Di sini, majoriti benzalacetophenone telah dikenal pasti dengan skor keserupaan dadah positif yang menunjukkan bioavailabiliti oral mereka [16]. Di samping itu, beberapa pengubahsuaian boleh dibuat dalam struktur fenon benzalaceto dengan skor keserupaan dadah negatif untuk meningkatkan bioavailabiliti oral mereka. Walau bagaimanapun, perlu diingatkan bahawa fungsi biologi mereka tidak boleh terjejas. Selanjutnya, 5 ligan teratas dengan skor keserupaan dadah positif iaitu abyssinone VI (c1), isobavachalcone (c11), 4-hydroxycordoin (c30), mallotophilippen E (c31), dan xanthohumol beroksigen (c39) telah diramalkan untuk mereka. lipofilisiti, keterlarutan air, farmakokinetik dan keserupaan dadah kerana ini adalah kekangan utama yang perlu dipertimbangkan untuk tindakan ubat. Menariknya, tiada satu pun daripada 5 hits ini melanggar Lipkinski (berat molekul<500, number of H-bond acceptors <10, number of H-bond donors <5, and XLogP<5) [36] and Veber (number of rotatable bonds ≤10, and the total polar surface area ≤140, also questions 500 molecular weight cutoff in Lipinski rule of 5) [37] rules. 

Di samping itu, sejumlah 55 laluan berbeza telah dikawal oleh benzalacetophenone di bawah penyiasatan di mana faktor boleh aruh hipoksia (HIF)-1, p53, faktor nuklear kappa B (NF-kB), reseptor seperti tol, nekrosis tumor faktor (TNF), kotak forkhead, subkumpulan O (FoxO), estrogen, Wnt, reseptor seperti NOD, dan laluan isyarat interleukin-17 (IL-17) dan interaksi reseptor sitokin-sitokin telah dikenal pasti. untuk mengambil berat dalammengawal selia imun. Telah dilaporkan bahawa ekspresi dan penstabilan HIF dicetuskan oleh hipoksia dan patogenesis yang berkaitan dengan mikrob. Selanjutnya, HIF mengawal seliafungsi imun hos, meningkatkan kapasiti mikrobisida fagosit dan pembezaan sel T diikuti dengan aktiviti sitotoksik. Di samping itu, laluan isyarat HIF memainkan peranan utama dalam keradangan, metabolisme dan polarisasi makrofaj, jangkitan mikrob (kedua-dua virus dan bakteria), persembahan antigen, danimuniti semula jadi[38]. Begitu juga, laluan isyarat HIF-1 (hsa04066) dikenal pasti dikawal melalui modulasi gen FLT1, GAPDH, HMOX1, NOS2, TFRC dan TIMP1 yang akan memainkan peranan penting dalam memanipulasisistem imundalam jangkitan coronavirus dan menangani keradangan pada tisu yang terjejas. Juga, laluan isyarat p53 memanipulasitindak balas imunmelalui transaktivasi pengawal selia utama bagilaluan isyarat imun.  

Rajah 10. Parameter yang menerangkan kestabilan struktur kompleks 3CLpro-Carmofur. (a) RMSD tulang belakang dan kompleks, (b) RMSF, (c) Rg, (d) SASA, (e) bilangan interaksi Hbond, dan (f) plot tenaga sumbangan yang menonjolkan kepentingan sisa poket pengikat dalam kompleks yang stabil pembentukan.

Rajah 11. Parameter yang menerangkan kestabilan struktur kompleks PLpro-4-hydroxycordoin. (a) RMSD tulang belakang dan kompleks, (b) RMSF, (c) Rg, (d) SASA, (e) bilangan interaksi ikatan-H, dan (f) plot tenaga sumbangan yang menonjolkan kepentingan sisa poket yang mengikat dalam pembentukan kompleks yang stabil.

Selanjutnya, pelbagai gen daripada laluan isyarat p53 juga dilaporkan dalam pengeluaran sitokin, penderiaan patogen, keradangan, dan pembersihan sel mati [39]. Oleh itu, benzalacetophenones boleh terlibat dalam mengawal selia gen CASP8, CCND2, CHEK1, dan MDM2 daripada laluan isyarat p53 (hsa04115), dan boleh mencetuskan sitokin untuk meningkatkan imuniti diikuti dengan pembersihan tisu mati dari badan. Sitokin radang seperti TNF atau IL mempengaruhi tindak balas imun semula jadi dan adaptif. Di samping itu, kepentingannya telah digambarkan dengan menerima patogenesis yang dijana melalui penyumbatan sitokin tunggal seperti IL-6 atau TNF [40]. Di sini, benzalacetophenones juga diprediksikan untuk memodulasi berbilang laluan seperti NF-kB (hsa04064), TNF (hsa04668) dan laluan isyarat IL-17 (hsa04657) dan interaksi reseptor sitokin-sitokin (hsa04060) yang secara langsung berkaitan dengan keradangan. sitokin. Reseptor seperti tol biasanya dinyatakan dalam sel sentinel (sel dendritik dan makrofaj) untuk mengenali molekul terpelihara struktur yang berasal dari mikrob dan memainkan peranan penting dalamsistem imun semula jadi. Di samping itu, mereka merekrut molekul penyesuai khusus, mengaktifkan faktor transkripsi seperti NF-kB, menyatakan hasil tindak balas imun semula jadi, dan memainkan peranan penting dalam pelbagai aspek tindak balas imun semula jadi kepada patogen [41]. Di sini, benzalacetophenone dikenal pasti untuk mengawal tiga protein iaitu CASP8, CD14 dan CD86 dalam laluan isyarat reseptor seperti tol. Selanjutnya, faktor transkripsi subfamili FoxO dari dahi (Fox) memainkan peranan penting dalam sel dan fungsi homeostatiksel yang berkaitan dengan imuntermasuk sel T, sel B, neutrofil, dan keturunan bukan limfoid lain [42]. Selanjutnya, benzalacetophenone mengawal selia laluan isyarat FoxO (hsa04068) dengan memodulasi tiga protein (CAT, CCND2 dan MDM2) terhadap 130 protein latar belakang dengan kadar penemuan palsu 0.0137. Begitu juga, reseptor estrogen telah diakui untuk membangunkan sel imun diikuti dengan penyertaan mereka dalam isyarat steroid yang dimulakan oleh membran. Di samping itu, mereka menghasilkan interferon jenis I dan juga pengeluaran sitokin semula jadi dan membangunkan atau berfungsi sebagai tindak balas sel imun semula jadi [43]. Begitu juga, kerja ini menunjukkan benzalacetophenones untuk mengawal selia laluan isyarat estrogen (hsa04915) melalui modulasi tiga protein iaitu MMP2, PGR, dan RARA yang boleh mencetuskan pengeluaran interferon dan sitokin dan membantu dalam tindak balas pantas sel imun. Begitu juga, isyarat Wnt memainkan peranan penting dalam pelbagai proses biologi termasuk pengawalan sel imun yang sangat pelbagai dalam pembangunan sel pembunuh semulajadi, permulaan sel T, tindakan makrofaj pada pembaikan tisu, dan thymopoiesis sel T [44]. Di sini, fenon benzalaceto mengawal laluan isyarat Wnt (hsa04310) melalui modulasi tiga protein iaitu CCND2, CTNNB1 dan MMP7, dan boleh menyumbang kepada pembangunan dan mengawal selia sel pembunuh semulajadi, sel T dan makrofaj. Begitu juga, reseptor seperti NOD berfungsi dalam pengecaman mikrob, dan mekanisme pertahanan hos dilaporkan dan juga mencetuskan tindak balas imun semula jadi hos. Selain itu, keluarga reseptor seperti NOD bimbang dengan interaksi hos-patogen dan tindak balas keradangan [45] yang telah dikawal melalui modulasi 3 protein iaitu CASP8, CCL2, dan CYBA.

Dalam interaksi benzalacetophenones-targets-pathways, berbilang parameter keseluruhan rangkaian telah dinilai. Kesambungan purata semua nod dengan jiran mereka ditakrifkan oleh "hubungan kejiranan" [46]. Pembolehubah ini ditakrifkan dalam rangkaian yang disebutkan di atas oleh jiran pada 63.8 peratus . Di samping itu, "antara pusat" mengukur kekerapan nod untuk hadir pada laluan terpendek antara nod lain. Ini menunjukkan nod untuk bertindak sebagai jambatan antara nod dalam rangkaian. Ini membantu untuk mengenal pasti laluan terpendek dan kekerapan nod bebas jatuh pada satu [47] yang diperhatikan berkorelasi dengan kiraan jiran sebanyak 1. Begitu juga, "kepusatan kedekatan" mengira setiap nod berdasarkan 'kedekatan' mereka dengan nod lain dan mengira laluan terpendek antara nod. Ini membantu untuk memahami pengaruh nod individu ke atas rangkaian yang diberikan dengan paling cepat [47]. Dalam kerja ini, keterpusatan keakraban diperhatikan bergantung kepada jiran sebanyak 2 peratus .

Semasa mengenal pasti ejen antivirus baharu untuk virus novel, mengesan sifat anti-virus ke arah virus yang diiktiraf dengan baik boleh memainkan permainan yang mudah. Dengan mengandaikan ini, kami menyiasat fenon benzalaceto yang diminati dalam spektrum biologi anti-virus. Dalam hal ini, diperhatikan bahawa benzalacetophenones terpilih mempunyai ciri-ciri anti-virus terhadap adeno, cytomegalo, hepatitis, herpes, trachoma, influenza, parainfluenza, picorna, pox, rhino, dan virus immunodeficiency manusia. Selanjutnya, analisis GO juga mengenal pasti peraturan laluan penyakit berjangkit iaitu jangkitan papillomavirus manusia (hsa05165), jangkitan herpesvirus berkaitan sarkoma Kaposi (hsa05167), karsinogenesis virus (hsa05203), jangkitan HTLV-I (hsa05166), jangkitan herpes simplex (hsa0516). ), dan miokarditis virus (hsa05416) yang berkenaan dengan jangkitan virus berkenaan pangkalan data KEGG. Keputusan ini seterusnya mendorong kami untuk menyiasat kemungkinan sifat anti-virus benzalacetophenones terhadap novel coronavirus.

Untuk menilai kemungkinan tindakan anti-virus benzalacetophenones terhadap SARS-CoV-2, kami menggunakan dok molekul dalam siliko dan simulasi MD eksplisit semua atom untuk menyiasat pertalian pengikatan ligan terhadap 3 sasaran novel coronavirus iaitu 3CLpro, PLpro, dan domain pengikat reseptor protein spike. Di sini, semua benzalacetophenone menjaringkan tenaga mengikat kurang daripada -5.0 kcal/mol. Sebatian selanjutnya berinteraksi dengan ketiga-tiga sasaran dengan sekurang-kurangnya satu interaksi ikatan H kecuali beberapa iaitu 4-chlorochalcone (c4), obochalcolactone (c17), 4′ -O-methylbavachalcone (c22), dan mallotophilippen E ( c31) dengan 3CLpro,2′ -hydroxychalcone (c2), 4-chlorochalcone (c4), 4- hydroxychalcone (c5), okanin (c7), 2′ ,3,4,4′ ,6 ′ -pentahydroxychalcone (c8), chalcone (c10), ( tambah )-tephrosone (c12), pinocembrinchalcone (c13), 4′ -O-methylbavachalcone (c22), dan 2′ ,4′ -dihydroxy-6′ - metoksi-3′ ,5′ -dimetilkalkon (c43) dengan PLpro dan 2' -hidroks ykalkon (c2), 4-klorokalkona (c4), kalkon (c10), desmethylxan thohumol (c21), 4 ′ -O-methylbavachalcone (c22), 7- methoxypraecansone B (c29), mallotophilippen C (c41), dan 2′ ,4′ - dihydroxy-6′ -methoxy-3′ ,5 ′ -dimetilkalkon (c43) dengan protein spike. Di samping itu, 3CLpro terdapat dalam nsp5 yang mengalami pembelahan auto dan melepaskan semua subunit replika hiliran untuk mengubah sistem ubiquitin yang mempengaruhi protein berfungsi [48] yang disasarkan terutamanya oleh obochalcolactone (c17) dengan - 8.5 kcal/mol tenaga mengikat walau bagaimanapun ia tidak mempunyai interaksi ikatan H. Kitaran virus coronavirus dikawal oleh protein replika yang dicetuskan melalui pp1a dan pp1ab dan diproses oleh PLpro [49] yang dimodulasi terutamanya oleh 4-hydroxycordoin (c30), dan xanthohumol (c38) dengan pertalian mengikat − 8.2 kcal/mol oleh kedua-dua ligan. Begitu juga, coronavirus menggunakan ACE2 sebagai pintu masuk untuk memasuki sel hos [50,51] dan disasarkan terutamanya oleh abyssinone VI (c1). Keputusan ini mencerminkan berbilang molekul (dari kategori yang sama) yang mungkin digunakan untuk menyasarkan pelbagai tapak anatomi virus kerana pertalian mereka terhadap berbilang protein melalui teori interaksi "multi-compound (s)-multi protein(s)". Salah satu aspek penting dalam kajian yang dibentangkan ialah pengenalpastian perencat kemasukan virus yang meliputi 7.71 peratus daripada jumlah benzalacetophenone yang sedang disiasat (Rajah 7). Oleh itu, pengikatan benzalacetophenone dengan domain pengikat reseptor protein spike telah ditambah sebagai protein spike dan merupakan kunci langsung untuk menggosok homeostasis sel normal. Di samping itu, salah satu aspek penting yang perlu dipertimbangkan ialah "tempoh sasaran tepat-kanan molekul yang betul" sebagai penilaian yang tidak rasional boleh menyebabkan takifilaksis terhadap patogenesis minat termasuk COVID-19 yang boleh diselesaikan melalui "komponen berbilang interaksi -multi protein" berbanding teori interaksi "kompaun tunggal-sasaran tunggal". Di samping itu, kajian ini menunjukkan peraturan beberapa laluan tertentu iaitu laluan isyarat TNF, NF-kB dan IL{105}} dan interaksi reseptor sitokin-sitokin (Rajah 17) yang berkaitan secara langsung denganperaturan imundan juga memanipulasi ribut sitokin.

Rajah 16. Matriks korelasi silang dinamik atom C diperhatikan dalam kompleks untuk benzalacetophenones (A, C, E) dan ubat standard (B, D, F) dengan 3CLpro, PLpro, danprotein spike, masing-masing. Kawasan positif, yang berwarna ambar, mewakili pergerakan atom C yang berkorelasi kuat (Cij=1), manakala kawasan negatifkawasan, yang berwarna biru, mewakili gerakan antikorelasi (Cij=-1).

Sebelum ini, pelbagai penyiasatan telah dibuat untuk melaksanakan pemodelan homologi, dok molekul, simulasi MD, dan penilaian MM-PBSA untuk merekodkan kebolehubahan pengangkutan dadah, pengenalpastian perencatan alosterik protein, pengaruh kiral dalam perencatan enzim terpilih, meneroka mod tidak boleh ditarik balik. daripada reseptor, dan penilaian interaksi ligan-protein [52-56]. Begitu juga, dalam kerja ini, kestabilan interaksi antara molekul sebatian plumbum berpotensi dan molekul piawai yang dikenal pasti dengan sasaran masing-masing dianalisis melalui simulasi MD klasik untuk 150 ns (protein spike - mallotophilippen D (c42) kompleks untuk 200 ns). Keputusan mendedahkan bahawa 3'-(3-metil-2-butenyl)-4′ -O- -D-glucopyranosyl-4, 2′ -dihydroxychalcone (c35) dipamerkan dinamik stabil dengan 3CLpro berbanding carmofur molekul standard. Sebelum ini, carmofur dilaporkan menghalang replikasi coronavirus dalam sel Vero E6 (EC50=24.30 μM) dengan berinteraksi dengan sisa Cys145 3CLpro [57]. Begitu juga, dalam kajian ini, carmofur diramalkan berinteraksi dengan sisa Cys145 dengan menjaringkan tenaga sumbangan sebanyak -1.42 kJ/mol, manakala, 3'-(3-metil-2-butenyl)-4 ′ -O- -D-glucopyranosyl-4,2′ -dihydroxychalcone sebatian menjaringkan − 4.24 kJ/mol untuk Cys145. Selain itu, Cys145–His41 ialah dua residu dyad pemangkin 3CLpro untuk memainkan peranan penting dalam pembelahan poliprotein SARS-CoV-2 [58]. Di samping itu, kumpulan penyelidikan lain juga melaporkan potensi peranan menyasarkan Cys145 untuk mereka bentuk antiviral novel terhadap 3CLpro [59,60]. Menariknya, kami memerhatikan interaksi tapak mengikat yang terpelihara (Thr25, Met49, dan Met165) dalam kedua-dua sebatian ini semasa simulasi MD 150 ns. Begitu juga, 4-hydroxycordoin (c30) telah disaring sebagai perencat PLpro dan membentuk kompleks yang stabil berbanding dengan molekul standard GRL-0617. Sebelum ini, GRL-0617 telah dilaporkan sebagai perencat PLpro yang kuat dalam sel Vero E6 yang dijangkiti SARS-CoV-2 dengan IC50 sebanyak 2.1 μM [61, 62]. Dalam kajian ini, kedua-dua GRL-0617 dan 4-hydroxycordoin (c30) membentuk RMSD yang stabil dan berkongsi interaksi biasa dengan Ile223 dan Pro248 sepanjang 150 ns dan 200 ns pengeluaran MD, masing-masing, dan mendedahkan kedua-duanya sebagai sesuai. hits sebagai perencat PLpro.

Di samping itu, sebelum ini, Bojadzic et al. melaporkan DRI-C23041 untuk menghalang domain RBD protein spike dengan IC50 sebanyak 0.52 μM [63]. Dalam kajian ini, mallotophilippen D (c42) telah dikenal pasti sebagai pengawal selia pro tein spike dan menunjukkan pertalian pengikatan yang lebih baik terhadap domain RBD protein spike berbanding molekul standard DRI-C23041. Keputusan MM-PBSA mendedahkan bahawa mallotophilippen D (c42) mempunyai tenaga bebas mengikat -34.10 kcal/mol, manakala, -3.10 kcal/mol oleh DRI-C23041 yang menunjukkan pertalian yang lebih tinggi bagi mallotophilippen D (c42) kepada protein spike . Selanjutnya, kedua-dua DRI-C23041 dan mallotophilippenD (c42) didapati berinteraksi dengan residu biasa Leu368 domain RBD protein spike semasa simulasi MD 150 ns. Penyiasatan kompleks untuk PCA dan DCCM juga menunjukkan bahawa kalkon dengan 3CLpro, PLpro, dan protein spike diseimbangkan dan distabilkan dengan baik semasa simulasi melalui menduduki ruang konformasi yang agak lebih rendah dan kelenturan konformasi dengan bilangan minimum konformasi pelbagai berbanding dengan molekul standard. Kontemporari, 4-hydroxycordoin (c30), sebatian dengan skor keserupaan dadah tertinggi mengawal 9 protein iaitu FLT1, CD86, CASP8, RARA, KLK3, PLAT, CTNNB1, HMOX1 dan TOP2A di mana 6 protein iaitu CASP8, CTNNB1, TOP2A, CD86, PLAT dan HMOX1 dikesan prihatin dengan jangkitan virus. CASP8 mengekodkan caspase 8; patogen virus yang menyasarkan sel apoptosis yang bergantung kepada CASP8-dan laluan kematian sel nekrotik yang bergantung pada protein berinteraksi reseptor (RIP) 1 dan 3. Oleh itu, memperoleh aktiviti CASP8 menekan RIP1 dan 3 untuk menguatkan peranan dalam pertahanan tuan rumah terhadap patogen virus intraselular [64]. Begitu juga, CTNNB1 mengekodkan catenin -1 dan bertanggungjawab untuk sintesis protein interferon [65], dan merupakan modulator utama bagi tindak balas imun. Di samping itu, ia boleh mengganggu jangkitan virus [66]. Begitu juga, kod TOP2A topoisomerase 2 dan perencatannya mendorong kerosakan asid deoksiribonukleik telomerik dan disfungsi sel T semasa jangkitan virus kronik [67]. Selanjutnya, CD86 mengekodkan CD antigen pengaktifan T-limfosit86 dan mengawal CD8 antiviral serta fungsi T-Cell dan pengawasan imun [68]. PLAT mengodkan pengaktif plasminogen dan menyumbang kepada keradangan yang merosakkan paru-paru dan pembentukan bekuan fibrin tempatan; mungkin terlibat dalam pertahanan perumah terhadap jangkitan virus influenza [69]. Begitu juga, HMOX1 mengekodkan heme oxygenase 1. Sebelum ini, protein kerangka bacaan terbuka 3a SARS-CoV{69}} dilaporkan mengikat kepada protein HMOX1 manusia dengan keyakinan tinggi. Laluan HMOX1 boleh menghalang pengagregatan platelet dan boleh mempunyai sifat anti-trombotik dan anti-radang, antara lain, yang kesemuanya adalah keadaan perubatan kritikal yang diperhatikan pada pesakit-19 COVID [70].

Sebelum ini, telah ditunjukkan bahawa RNA genom SARS-CoV-2 boleh memanipulasi gen imun dan melucutkan fungsinya. Di samping itu, telah dinyatakan bahawa RNA genomik boleh mencetuskan interaksi interleukin dan juga boleh mencetuskan ribut sitokin [71]. Selain itu, kajian meneroka bahagian kecil mikroRNA (miRNA) dalam jangkitan COVID untuk mengelakkan pengecaman dan serangan daripada tindak balas imun. Sekejap sahaja SARS-CoV-2 boleh bertindak sebagai kapas atau span untuk menyerap miRNA dan memaksa disfungsi sistem imun. Di samping itu, ia mengekod miRNAnya, memasuki sel perumah, dan diiktiraf oleh sistem imun perumah [72].

Memandangkan benzalacetophenones (kalkon) dilaporkan dalam memanipulasi tindak balas imun [11], dan RNA prihatin dengan sintesis gen imun, kemungkinan peranan mereka dalam memanipulasi hos interaksi RNA genomik perlu disiasat lebih lanjut.

5. Kesimpulan

Kajian ini menyiasat berbilang benzalacetophenone sebagai penggalak imun dan spektrum anti-virusnya terhadap SARS-CoV-2. Kajian ini melaporkan kemungkinan agen antiviral plumbum iaitu abyssinone VI (c1), isobutrin (c16), obochalcolactone (c17), 4-hydroxycordoin (c30),3'-(3-methyl-2-butenyl )-4′-O- -D-glucopyranosyl-4,2′-dihydrox ychalcone (c35), xanthohumol (c38) dan 4-mallotophilippen D (c42) terhadap COVID -19 dengan menyasarkan 3CLpro, PLpro dan protein spike. Di samping itu, analisis pengayaan mengenal pasti peraturan pelbagai

laluan seperti HIF-1, p53, NF-kB, Reseptor seperti Tol, TNF, FoxO, estrogen, Wnt dan IL-17. Juga, reseptor seperti NOD dan reseptor sitokin-sitokin telah dicetuskan yang secara langsung berkaitan dengan mengawal sistem imun dan memanipulasi ribut sitokin. Begitu juga, terdapat pencetus pelbagai laluan terhadap jangkitan virus dan bakteria serta penyahkawalseliaan endokrin di mana sistem imun terutamanya terjejas. Keputusan ini mencadangkan pilihan terapeutik derivatif benzalacetophenone terhadap COVID-19. Mengehadkan kepada penemuan sekarang, kami menunjukkan bahawa penemuan yang dibentangkan dalam kerja ini adalah berdasarkan simulasi pemproses yang perlu disahkan lebih lanjut dengan protokol eksperimen makmal basah.

Rujukan

[1] AR Fehr, S. Perlman, Coronavirus: gambaran keseluruhan replikasi dan patogenesisnya, Kaedah Mol. biol. 1282 (2015) 1–23, https://doi.org/10.1007/978- 1-4939-2438-7_1.

[2] Y. Dong, X. Mo, Y. Hu, X. Qi, F. Jiang, Z. Jiang, S. Tong, Epidemiologi COVID-19 dalam kalangan kanak-kanak di China, Pediatrik 145 (2020), e20200702, https://doi.org/ 10.1542/peds.2020-0702.

[3] CJ Andersen, KE Murphy, ML Fernandez, Kesan obesiti dan sindrom metabolik pada imuniti, Adv. Nutr. 7 (2016) 66–75, https://doi.org/10.3945/ an.115.010207.

[4] SG Deeks, BD Walker, Tindak balas imun terhadap jangkitan virus AIDS: baik, buruk, atau kedua-duanya, J. Clin. melabur. 113 (2004) 808–810, https://doi.org/10.1172/JCI21318.

[5] M. Gendrot, E. Javelle, A. Clerc, H. Savini, B. Pradines, Chloroquine sebagai agen profilaksis terhadap COVID-19, Int. J. Antimikrob. Ejen 55 (2020), 105980, https://doi.org/10.1016/j.ijantimicag.2020.105980.

[6] V. Mody, J. Ho, S. Wills, A. Mawri, L. Lawson, MCCJC Ebert, GM Fortin, S. Rayalam, S. Taval, Pengenalpastian 3-chymotrypsin seperti protease (3CLPro) perencat sebagai agen anti-SARS-CoV-2 yang berpotensi, Commun Biol 4 (2021) 93, https:// doi.org/10.1038/s42003-020-01577-x.

[7] D. Shin, R. Mukherjee, D. Grewe, D. Bojkova, K. Baek, A. Bhattacharya, L. Schulz, M. Widera, AR Mehdipour, G. Tascher, PP Geurink, A. Wilhelm, GJ van der Heden van Noort, H. Ovaa, S. Müller, KP Knobeloch, K. Rajalingam, BA Schulman, J. Cinatl, G. Hummer, S. Ciesek, I. Dikic, protease seperti Papain mengawal selia SARS-CoV{{ 3}} penyebaran virus dan imuniti semula jadi, Nature 587 (2020) 657–662, https://doi.org/10.1038/s41586-020-2601-5.

[8] Y. Huang, C. Yang, XF Xu, W. Xu, SW Liu, Ciri struktur dan fungsi protein spike SARS-CoV-2: pembangunan ubat antivirus yang berpotensi untuk COVID-19, Acta Pharmacol. Dosa. 41 (2020) 1141–1149, https://doi.org/10.1038/s41401-020- 0485-4.

[9] F. Yazdanpanah, MR Hamblin, N. Rezaei, Thesistem imundan COVID-19: kawan atau lawan, Life Sci. 256 (2020), 117900, https://doi.org/10.1016/j. lfs.2020.117900.

[10] Z. Rozmer, P. Perj´esi, Chalcones semulajadi dan aktiviti biologinya, Phytochemistry Rev. 15 (2016) 87–120, https://doi.org/10.1007/s11101-014- 9387-8.

[11] JS Lee, SN Bukhari, NM Fauzi, Kesan derivatif chalcone pada pemain sistem imun, Drug Des DevelTher 9 (2015) 4761–4778, https://doi.org/ 10.2147/DDDT.S{{7 }}.

[12] D. Zhou, D. Xie, F. He, B. Song, D. Hu, Sifat antivirus dan interaksi derivatif chalcone novel yang mengandungi bahagian purin dan benzenesulfonamide, Bioorg. Med. Kimia. Lett 28 (2018) 2091–2097, https://doi.org/10.1016/j. bmcl.2018.04.042.

[13] X. Tang, S. Su, M. Chen, J. He, R. Xia, T. Guo, Y. Chen, C. Zhang, J. Wang, W. Xue, Novel derivatif chalcone yang mengandungi 1, 2,4-bahagian triazine: reka bentuk, sintesis, aktiviti antibakteria dan antivirus, RSC Adv. 9 (2019) 6011–6020, https://doi. org/10.1039/C9RA00618D.

[14] Y. Fu, D. Liu, H. Zeng, X. Ren, B. Song, D. Hu, X. Gan, Derivatif chalcone baharu: sintesis, aktiviti antivirus dan mekanisme tindakan, RSC Adv. 10 (2020) 24483–24490, https://doi.org/10.1039/D0RA03684F.

[15] A. Lagunin, S. Ivanov, A. Rudik, D. Filimonov, V. Poroikov, DIGEP-Pred: perkhidmatan web untuk ramalan in silico profil ekspresi gen yang disebabkan oleh dadah berdasarkan formula struktur, Bioinformatics 29 (2013) 2062–2063, https://doi.org/ 10.1093/bioinformatics/btt322.

[16] CA Lipinski, Plumbum dan sebatian seperti dadah: revolusi peraturan lima, Drug Discov. Hari ini Technol. 1 (2004) 337–341, https://doi.org/10.1016/j. ddtec.2004.11.007.